现对你咨询的情况简要回复如下：

1、个人所得税可以在你电脑安装的个税申报客户端申报，当年的都可以补申报，税务不罚款。

2、至于你说的增值税三个月没有申报，不知道你是小规模纳税人还是一般纳税人？小规模纳税人就是按季申报，如果正好是一个季度的三个月没有申报，可以在下季度首月的15日（遇节假日顺延）内申报。如果你是一般纳税人，就要按月申报，次月的15号（遇节假日顺延）报上月的税。

3、如果你逾期没有申报增值税，就要被罚款。你可以联系你的税务专管员，说明逾期没有申报的原因，讲点情，一般罚款200元，税务开出罚款单，你把没有申报月份的增值税申报表填好，去所属地税务局的办税窗口，先交罚款，后补申报就行了。

4、建议：逾期没有申报的原因要找出来，杜绝此类情况再发生。逾期没有申报会扣分，影响你公司的税务信用等级。

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