公司被税务稽查，有以下几点原因：

企业会计账簿有猫腻，有逃税嫌疑。现在大大小小的公司都有使用不同的手段来做账，达到少缴税的目的，只不过有的企业高明，有的企业漏洞百出，很容易就引起税务方面的主意。另外，当今税务稽查基本都实现了信息化，商委、国地税、工商部门的信息共享化，而且政府、公安、检察、审计等相关部门只要有线索，都可以要求税务稽查跟进检查。所以不想被税务稽查盯上，光税务没问题是不够的，各方面都要遵章守纪。

被某些不愿透露姓名的人举报。举报是税务稽查的主要案件来源，一旦企业存在经营不规范、财务不健全的情况，或偷税漏税嫌疑，被相关人员掌握了信息并实名举报，如果证据比较充分、事实比较清楚的话，税务稽查也会立案调查，并进行相应的处理。

不幸被税务局抽中。现在每年国家税务总局也有进行随机抽选企业进行税务稽查，虽然现在企业非常多，税务人力有限，抽样不会太多，虽然企业被随机抽中的概率并不高，但是总会有一些企业幸运的“中了奖”。与此类似的还有工商部门的“双随机”抽查。

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