您好，其实这个问题形成的原因就是我国会计制度转轨规则不到位造成的，以前我国是根据行业制定会计制度的，例如建筑行业、行政事业单位等，后来我国会计进行了改革，变成了《企业会计制度》《小企业会计制度》和《金融企业会计制度》三个，取消了原先的行业划分，后来《企业会计制度》进一步变成现在主流的会计准则。
所以如果税务局的专管员通知你用《小企业会计制度》的话，最好使用小企业会计制度而不要采用工业企业的会计制度，因为毕竟按照小企业会计制度比较新。
二者的区别本质上是由分类标准不同造成的，小企业会计制度是按照企业的规模来划分的而工业企业的会计制度是按照行业划分的。对于月末报表的影响应该是科目上有些影响的，不过估计影响程度不大，可能就是有些工业企业的科目小企业会计制度上没有，或者小企业会计制度有的工业企业没有。
希望对你有帮助！

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