区别主要是在扣除项目的计算上吧。

取得土地使用权时缴纳的契税：房地产开发企业可以作为扣除并可作为加计扣除的基数，但非房地产企业不能扣除；

转让土地使用权时缴纳的印花税：房地产开发企业不能扣除，但非房地产企业可以扣除；（其实上两项都与会计制度的规定有关）还有重要一项，房地产开发企业可以享受（取得土地使用权支付的金额+房地产开发成本)两项加计20%扣除，但前提是转让的不是生地哈。

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