一般是建设单位（就是你指的甲方）去当地建设主管部门备案，因为备案需要提交备案文件，包括项目的规划许可证、施工许可证、竣工验收证书、施工合同等等文件，施工单位有些资料无法收集。
这要看有些工程和地方的要求，我在做的一个市政工程，我们自己去备的案，找业主要的资料。

竣工财务决算中支付的审计费超过标准怎么办

基本建设投资支出超支的原因，主要是进行计划外工程、任意提高建设标准、拖长了工期、增加了费用开支等等。对于这些情况，都应查明原因，采取对策。工程竣工决算审计是工程项目的重要环节，是为保障项目合法合规，由审计人员依法对建设项目竣工决算的正确性、真实性、合法性和实现的经济效益、社会效益及环境效益进行的检查、评价和鉴证。事实上，工程造价审计收费通常采用基本收费+追加收费两部分组成，基本收费一般定为建设单位送审总造价的0.1--0.3%左右，追加收费一般定为中价机构审减金额的4--9%左右。

工程结算收费标准

法律分析：工程结算审计收费标准

1、基本审计费。按单项工程总投资额计取，不管有无审减(增)额都的计取。是保底的。

2、审减(增)额审计费。按审减(增)额减允许额的余额计取。如有项100万投资额的工程。审计结果：审减额为8万，其中允许差额为5万，审减余额为3万。审计额费率商定为6，100万x千分之六+3万x百分之五=0.6万+0.15万=0.75万。

法律依据：《中华人民共和国审计法》

第三十八条 审计机关根据审计项目计划确定的审计事项组成审计组，并应当在实施审计三日前，向被审计单位送达审计通知书;遇有特殊情况，经本级人民政府批准，审计机关可以直接持审计通知书实施审计。被审计单位应当配合审计机关的工作，并提供必要的工作条件。审计机关应当提高审计工作效率。

第三十九 条审计人员通过审查会计凭证、会计账簿、财务会计报告，查阅与审计事项有关的文件、资料，检查现金、实物、有价证券，向有关单位和个人调查等方式进行审计，并取得证明材料。审计人员向有关单位和个人进行调查时，应当出示审计人员的工作证件和审计通知书副本。

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